鱼类粘孢子虫检测方法DB43/T 2816-2023.pdf

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ICS 65.020.30 CCS B44 43 湖南省地方标准 DB 43/T 28162023 鱼类粘孢子虫检测方法 Detection methods of fish myxosporean 2023-11-09 发布 2024-02-09 实施 湖南省市场监督管理局 发 布 DB 43/T 28162023 I 目 次 前言.II 1 范围.1 2 规 范性 引用 文件.1 3 术 语和 定义.1 4 试 剂与 材料.1 5 仪 器与 设备.1 6 采样.2 7 检查 步骤.2 8 结果 判定.3 附录A(规 范性)试剂 及其 配制.4 附录B(资 料性)不同 粘孢 子虫 感染 症状及 包 囊形 态.5 附录C(资 料性)几种 常见 粘孢 子虫 成熟孢 子 形态.6 DB 43/T 28162023 II 前 言 本文件 按照GB/T 1.12020 标 准化 工作 导则 第1 部分:标 准化 文件 的结 构和 起草 规则 的规定起草。请注意 本文 件的 某些 内容 可能 涉及 专利。本 文件的 发布 机构 不承 担识 别专 利的 责任。本文件 由湖 南省 农业 农村 厅提 出。本文件 由湖 南省 农业 标准 化技 术委 员会 归口。本 文 件起 草单 位:湖南 农 业大 学、湖南 应用 技术学 院、资兴 市水 产良 种场、中国 科学 院 水生生 物研究所。本 文 件主 要起 草人:刘新 华、任 诗思、皮杰、李 德 亮、向建 国、余 建波、吕欣 荣、刘 志辉、叶 少 文。DB 43/T 28162023 1 鱼类粘孢子虫检测方法 1 范围 本文件 给出 了湖 泊鱼 类粘 孢子 虫检 测的 试剂 与材料、仪器 和设 备、采 样、检查 步骤 与结 果 判定方 法。本文件 适用 于鱼 类粘 孢子 虫的 检测。2 规范性 引用 文件 下列文 件中 的内 容通 过文 中的 规范 性引 用而 构成本 文件 必不 可少 的条 款。其 中,注日 期的 引用文 件,仅 该 日期 对应 的版 本适 用于 本文 件;不注 日期 的 引用 文件,其 最新 版本(包 括所 有的 修改 单)适用 于本文件。SC/T 7103 水 生动 物产 地检 疫采 样技 术规范 SC/T 7223.1 黏孢 子虫 病诊 断规 程 第1 部 分:洪 湖碘 泡虫 SC/T 7223.2 黏孢 子虫 病诊 断规 程 第2 部 分:吴 李碘 泡虫 SC/T 7223.3 黏孢 子虫 病诊 断规 程 第3 部 分:武 汉单 极虫 SC/T 7223.4 黏孢 子虫 病诊 断规 程 第4 部 分:吉 陶单 极虫 SN/T 2503 淡 水鱼 中寄 生虫 检疫 技术 规范 3 术语和 定义 本文件 没有 需要 界定 的术 语和 定义。4 试剂与 材料 本标准 所使 用的 试剂 均为 分析 纯,水为 蒸馏 水。乙醇:70%乙醇。溴酚蓝。10 xPCR Buffer MIX:-20 保 存,避免 反复 冻融。引物序 列 上游引 物:5-GAT TGA CGA GGT CGT TCG TTT A-3;下游引 物:5-AGT AGG CCC TTA CCC TAC TTA C-3;本对引 物扩 增小 核糖 体小 亚基rRNA 基 因(18S rDNA)的部 分序 列。DNA marker 2000(bp):2000、1000、750、500、250、100。5 仪器与 设备 解剖盘、剪 刀、镊子、解 剖针、解 剖刀。体视显 微镜 和带 测微 标尺 的光 学显 微镜。盖玻片、载 玻片、培 养皿、巴 氏吸 管。恒温水 浴锅(控 温范 围:RT-100 1)。DB 43/T 28162023 2-20 和-80 冰 箱。微量移 液器(0.5 L 10 L,10 L 100 L,100 L 1000 L)。PCR 扩增 仪。离心管 和PCR 管。高压灭 菌锅。超净工 作台。水平电 泳系 统。紫外透 射仪 或凝 胶成 像系 统。6 采样 样品的 采集 应符 合SC/T 7103、SC/T 7223.1、SC/T 7223.2、SC/T 7223.3 和SC/T 7223.4 中 的相关要求,样 品封 存和 运输 应符 合SC/T 7103 的相关 规定。7 检查步 骤 目检 观察样 品,检查 顺序 应符 合SN/T 2503 中 的 相关要 求,先检 查体 表部 位是 否有 明显 的白 色包囊 或似包 囊 状瘤 状物,如体 表皮 肤、鳍、鼻腔、口腔、眼 球等,随后 解剖 鱼体 观察 内脏 是否 出现 白 色包 囊,包括体腔、脂 肪组 织、胃肠、肝、脾 等。镜检 7.2.1 当在7.1 中 发现 疑似 包囊 状物 时,用剪 刀与 镊子将 单个 或多 个包 囊分 离,置于 载玻 片上。然后,再用解 剖针 戳破 疑似 包囊 物,加入 约20 L-30 L 双 蒸水,盖 上盖 玻片 置于 光学 显微镜 中 观察 是否存在成 熟孢 子。7.2.2 当在鱼 体组 织中 未发现 疑似 包囊 状物 时,用 剪刀或 镊子 取少 量组织 或液 体(胆汁、血液、尿 液等)置 于载 玻片 上,用镊 子将 组织 分散,加 入约20 L-30 L 双蒸 水,盖上 盖玻 片,稍加 压平,置于光学 显微 镜中 观察 是否 存在 成熟 孢子。分子鉴 定 7.3.1 检测样 本固 定 将6.2 中粘 孢子 虫感 染的 包囊 或组 织从 宿主 上分离,用浓 度大 于70%的乙 醇固 定于 离心 管中(参 见附录A),低温(-20)保存,标 识好 标签 并记录。7.3.2 DNA 提取 将6.2 固 定的 样品 充分 混匀,破碎 后用 磷酸盐 缓 冲液 洗涤 两次 以去 除残 余酒 精。将 离心管 置 于-80 冰箱快 速冷 冻5 min,取 出并 立即 置于80 水 浴 锅中5 min,重 复三 次后 镜检 观察 孢子是 否 完全 破碎,极丝是 否挤 出。破碎 后利 用细 胞/组织 基因组 DNA 提 取试 剂盒,提 取样 品基 因组 DNA。提取好 的基 因组DNA 置于-20 保 存备 用。7.3.3 PCR 扩增 DB 43/T 28162023 3 在 50 L 的 PCR 反应 体系 中,包含 模板 基因 组DNA 2 L、10PCR Buffer MIX(康 为世纪)25 L、上 游引 物和 下游 引物(10 M/L)各 2 L、加 双蒸 水定 容至50 L。在PCR 扩 增仪 中,反应 程序 为94 预 变性 4 min;94 变性 1 min;46 退 火50s;65 延伸 1 min,35 个循 环;65 终 延伸 10 min。PCR 扩 增时,应 设置 阴性 对照 和阳 性对 照。7.3.4 PCR 产 物电 泳与 测序 取5 微升PCR 扩 增产 物,用添 加溴 酚蓝 指示 剂的1.0%琼脂 糖凝 胶于 TAE 缓冲 液(参见 附录 A)中 电泳 分 离,同时 设置DNA 分 子量 标准 作参 照,紫外透 射仪 下检 查是 否存 在大 约900bp 的目 的条带。如果 存在,则 取PCR 扩增 产物 测序,测 序后 通过GenBank 进行BLAST 比 对。8 结果判 定 目检 当肉眼 观察 到明 显白 色包 囊或 白色 囊状 物(见附录B),可 以怀 疑为 粘孢 子虫 感染,但需 经 8.2、8.3 步 骤检 查后 才能 进一 步确 诊。镜检 8.2.1 将经8.1 步骤 检查 未观 察到 明显 包囊 的组 织进 一 步置 于解 剖镜 下,观察 是否 有肉 眼不 可见 的白色包囊(见附 录B),如观 察到 需将 其从 组 织中分 离,并经7.2.2 进行 观察 后确 诊。8.2.2 将经8.1 和 8.2.1 步骤 观察 的疑 似包 囊以 及外 观 正常 的少 量组 织进 行压 片,观察 到明 显的 粘孢子虫成 熟孢 子即 可确 诊(见 附录C)。分子鉴 定 将所测 定的 18S rDNA 序列(900 bp 左 右)与 GenBank 数据 库中 粘孢 子虫 序列 进行 比对,如比 对出来的种 类均 为粘 孢子 虫序 列相 似性 在80%以上,亦可 判定 为粘 孢子 虫。DB 43/T 28162023 4 A A 附录A(规范 性)试剂及 其配 制 A.1 70%乙醇 溶液 70 mL 无水 乙醇 溶液,加30mL PBS 缓 冲液(0.01 mol/L,pH7.4)。A.2 磷酸盐 缓冲 液(0.01 mol/L,pH7.4)称 7.9g NaCl,0.2g KCl,0.24g KH2PO4(or 1.44g Na2HPO4)和 1.8g K2HPO4,溶 于 800 ml 蒸 馏水中,用HCl 调 节溶 液的pH 值至7.4,最 后加 双蒸水 定容 至1 L,4 冰 箱保 存。A.3 TAE 电泳 缓冲 液(50 倍)称量242.0 g Tris 碱、37.2 g Na2EDTA2H2O 混合,然 后加 入800 mL 的去 离子 水充 分搅 拌 溶解,再加入57.1ml 的冰 乙酸,充 分混 匀,加去离 子 水定 容至1L,室 温保 存。A.4 溴酚蓝 指示 剂溶 液 取溴酚 蓝 100 mg,加 双蒸 水 5 mL,在室 温下 过夜,待溶 解后 再称 取蔗 糖 25 g,加 双蒸 水溶 解 后移入溴酚 蓝溶 液中,摇 匀后 加双 蒸水 定容 至50 mL,加 入氢 氧化 钠(NaOH)溶液 1 滴,调至 蓝 色。DB 43/T 28162023 5 B B 附录B(资料 性)不同粘 孢子 虫感 染症 状及 包囊 形态 图B.1 不同 粘孢 子虫 病感 染症 状(A):普洛 宁碘 泡虫 感染 鲫鱼 腹腔 症状,靶尺=1 cm;(B):吉陶 单极 虫感 染散 鳞镜 鲤皮 肤症 状,靶 尺=5 cm;(C):米 氏碘 泡虫 感染 鲶肠 道症 状,靶尺=5 cm;(D):九州 碘泡 虫感 染鳙 鱼皮 肤,靶尺=5 mm;(E):汪氏 单极 虫感 染异 育银 鲫鳃 症状,靶尺=0.5 cm;(F):基部 碘泡 虫感 染拟 鲤鳃 基部 症状,靶尺=500 m。DB 43/T 28162023 6 C C 附录C(资料 性)几种常 见粘 孢子 虫成 熟孢 子形 态 图C.1 不同 粘孢 子虫 孢子 形态(A):巨间 碘泡 虫,靶尺=20 m;(B):帕夫 洛斯 碘泡 虫,靶尺=20 m;(C):多 涅茨 尾孢 虫,靶尺=10 m;(D):武汉 单极 虫,靶尺=5 m。
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