SNP标记法鉴定油莎豆种质资源、品种和纯度技术规程DB15／T 3450—2024.pdf

ICS 65.020.20 CCS B 05 15 内蒙古自治区地方标准 DB15/T 3450 2024 SNP 标记 法鉴定油 莎豆种质 资源、品种和纯 度技术规 程 Code of practice for identification of Cyperus esculentus germplasm resources,varieties and purity by SNP marker method 2024-06-14 发布 2024-07-14 实施 内蒙古自 治区市 场 监督管理 局 发 布 DB15/T 3450 2024 I 前 言 本文件 按照GB/T 1.1 2020 标 准化 工作 导则 第1 部分：标准 化文 件的 结构 和起草 规则 的 规 定起草。请注意 本文 件的 某些 内容 可能涉 及专 利。本文 件的 发布机 构不 承担 识别 专利 的责任。本文件 由内 蒙古 自治 区农 牧厅提 出。本文件 由内 蒙古 自治 区农 业标准 化技 术委 员会（SAM/TC 20）归 口。本文件 起草 单位：内 蒙古 自 治区农 牧业 科学 院、吉林 省 农业科 学院（中 国农 业科 技 东北创 新中 心）。本文件 主要 起草 人：牛陆、杨向 东、张立 华、任伟、张原 宇、侯智 惠、马瑞、胡可 欣、萨茹 拉、路战远、韩淑 娟、武玲 鑫、张宇佳、李 子南、韩 畅、郭茄。DB15/T 3450 2024 1 SNP 标记法鉴定 油莎豆种 质资源、品种和 纯度技 术 规程 1 范围 本文件 规定 了利 用单 核苷 酸多态 性（single nucleotide polymorphism,SNP）标记 进行 油莎 豆 种质资源、品 种及 纯度 鉴定 的操作 步骤 要求。本文件 适用 于油 莎豆 种质 资源、品种 及纯 度的 鉴定。2 规范性 引用 文件 下列文 件中 的内 容通 过文 中的规 范性 引用 而构 成本 文件必 不可 少的 条款。其 中，注日 期的 引用 文件，仅该日 期对 应的 版本 适用 于本文 件；不注 日期 的引 用文件，其 最新 版本（包 括所有 的修 改单）适 用 于 本文件。GB/T 3543.2 农作 物种 子 检验规 程 扦样 GB/T 3543.4 农作 物种 子 检验规 程 发芽 试验 3 术语和 定义 下列术 语和 定义 适用 于本 文件。SNP标记 single nucleotide polymorphism marker 单核苷 酸多 态性 分子 标记。推荐引 物 recommended primer 种质资 源和 品种 鉴定 中优 先选用 的一 套SNP 引 物，其 检测位 点多 态性 高，检测 结果重 复性 好。品种纯 度 varietal purity 品种在DNA 分 子标记 基因 分 型方面 一致的 程度，用供 检样品 中本品 种的 块茎数 占供检 样品块 茎总 数的百分 率表 示。4 操作步 骤 样品DNA 提取 4.1.1 样品准 备 DB15/T 3450 2024 2 试验样 品块 茎的 分样 与保 存，应 符合GB/T 3543.2 的 规定。4.1.2 用于种 质资 源和 品种 鉴定 样品 DNA 提取 从样品 中随 机抽 取10 粒块 茎发苗。分 单株 剪取0.1 g 幼苗叶 片用 液氮 研磨 成粉 末。将 研磨 粉末 转 入2 mL 离 心管，加 入0.7 mL CTAB 提 取缓 冲液 充分 混匀。在55 65 恒 浴1 h。加入0.7 mL 氯 仿：异戊醇（24:1），上 下轻 摇5 min。10000 g，室温 下离 心10 min。取 上清 液，加 入上清 液三 分之 二体 积预冷异丙 醇，上下 轻摇5 min，-20 冰 箱放 置30 min。10000 g，4 离 心10 min。沉淀 用1 mL75%的预冷乙醇 洗一 次。自然 干燥 后，用200 L 1 TE 缓 冲 液溶解，置4 保存。注：以 上 为 推荐 用于 种 质资 源 和品种 鉴 定 的DNA 提 取 方法，其 他 能够 达 到PCR 扩增 质 量要 求的DNA 提取方法都 适用 于本标准。4.1.3 用于纯 度鉴 定样 品 DNA 提取 按照GB/T 3543.4 规 定的 方法，从送 检样 品中 提取 不少 于 100 粒块 茎发 苗。提取方 法 同 4.1.2。注：以上为推荐用于纯度鉴定的DNA 提取方法，其他能够达到PCR 扩 增质量要求的DNA提取方法都适 用于本标准。PCR 扩增 4.2.1 引物筛 选 用于油 莎豆 种质 资源、品 种及纯 度鉴 定的73 组 推荐 引物及 其序 列，按照 附录A 执行。4.2.2 PCR 反应 PCR反 应在25 L的 反应 体 系中进 行。反应 体系 包括：2.5 L 10 PCR 缓 冲液，0.5 L 10 mmol/L dNTPs,0.5 L 5U/L Taq 酶，1.0 L 50 ng/L DNA 模 板，1.0 L 上下 游 引物混 合物(引 物浓 度10 umol/L)，19.5 L ddH2O。PCR 扩增 条件 为：95 预变性5 min；95 变性30 s，60 退火30 s，72 延伸45 s，30 个循 环，72 10 min。反 应利 用96孔PCR 板在PCR 扩 增仪 上进行。基因分 型检 测 采用一 代测 序（Sanger 测 序），对PCR 产 物进 行测 序，分析 不同 油莎 豆材 料SNP 位点变 异情 况。数据分 析与 判定 4.4.1 数据分 析 结合位 点的 基因 型数 据记 录为X/X 和Y/Y，其 中X、Y 为 同一位 点上 两个 不同 的等 位变异；杂合 位点 的基因型 数据 记录 为X/Y；缺 失位点 等位 变异 数据 记录 为-/-。油 莎豆73 个SNP 分 子标记 的信 息按 照附 录B 执行。4.4.2 种质资 源和 品种 鉴定 的判 定 根据样 品在73个SNP 位点 基 因型的 差异 进行 品种 鉴定，具体 判 定 标准 如下：差异位 点数 3，判 定为 不 同品种；差异位 点数 为 1 或2 个，判定为 近似 品种；差异位 点 数=0，判定 为极 近似或 相同 品种。对利用 附录A中73 组 引物 仍 未检测 到3个 差异 位点 数 的样品，必 要时 可增 加筛 选引物 进行 检测。4.4.3 纯度鉴 定的 判定 DB15/T 3450 2024 3 品种纯 度计 算公 式：品种 纯度%=（供 检种 子粒 数-非 本品种 种子 粒数）/供检 种 子粒数 100%。DB15/T 3450 2024 4 A A 附录A（规范 性）用于油 莎 豆SNP 检测 的 73 组推荐 引物 序列 用于油 莎豆SNP 检测 的73 组 推荐引 物序 列见 表A.1。表A.1 用于 油莎 豆SNP 检 测的73 组推 荐引 物序 列 引物名称 正向引物(5-3)反向引物(5-3)扩增长度(bp)CeSNP0859 TTCTCGGGCTAGTGAAACTTATGC AACATGTCCCGGACTTTGCTAATA 146 CeSNP1072 ACTGCAGATGGGAGCATTAGAATC TGGCACCTTCACTGCTCTTGTATA 259 CeSNP0414 GACCTGGTTGAAGTATGTCATCCC ATCATTCCACAACTGGACTTTGGT 365 CeSNP0939 GACCAAATCCACAAAAGCTGGTAC TTGGTAGGTTGGTTGGATTATTGG 378 CeSNP1035 AGTCCAATTGGGAGTTTGTTGTGT CAAACTGTGAGTTGCTGGAAGAGA 451 CeSNP1187 AAATCAAGTGAGCAAGGCTACAGG GAACCTCAATTCACCAAAACGATC 309 CeSNP0830 GATCCGGTACTTTCTAGCATCCCT ATCGTCCTCGTCGTAGATCAGAAC 392 CeSNP0093 TGAGAGAACTTTGCCTTACCTTGG TAGGGTTTACTGGTCGGGGAATAT 375 CeSNP0098 TGGAATCGTTCTTGACTAAGCACA ATTAACATCTCGATCAGGGGTCAA 479 CeSNP0243 GCACAGGACCTTGTAGTTCTTCGT AGATGGTGAATTTAGATGCCGTGT 437 CeSNP0432 CTCCGCGAACTTTGAGAAGATCTA GGTCCAAGATGAAATTCAGTGACC 438 CeSNP1018 ACCATACACAACATCATTGCAAGC CCCATCAATCCATAACAGGGATAA 492 CeSNP0395 CTGCTGAGCTCAAGAGAAGTGATG CCATTGTTGACGGATCTAGAGCTT 388 CeSNP0397 TTCTTCTCGATCTCGTCCTTGACT GAAAGAACCAAGAACCAAGCTTGA 474 CeSNP0541 CATACCATTGCCTCATGACATCTC CACAGAGGAGGCTGAAGATGTACA 384 CeSNP0014 AGAAACCGCTGAGAACTGGTACAC GCCTTTATCAGTAAGCAGGGAGGT 176 CeSNP0081 TAGAATTGTAGACAGCACCCGGTT AGAAAGAGCTCCCAGAAGCAAATT 403 CeSNP0739 GAGTGGGGACATTTCTCTGACACT GCCTAGGCCTAGCTGTTATGTTCA 225 CeSNP0742 GCCTTGGAGTTCAGTTGGGTATTA AAGGAAAACAGCCATCTGCAGTAC 495 CeSNP0748 ACCCAATACCATTACGCAGAAGAA TATGATTAAGCCCTTCAGCTCGAG 175 CeSNP0130 CGTCTTCAGAAGTAGGCCAAAGAA AAATGGGTCTAGCAGAAACCACTG 458 CeSNP0409 CAGAGGATAAGCGCTCCTACATGT ATGGATGGATGAGGAAAGAACGTA 204 CeSNP0803 TGGTTCAAAGATCTGTTCTTGTGG CCTTCAGCAGGAGTTAAACACCAT 153 CeSNP1022 TAACCCCATCCAGAGCACTGTATT AAGCACAATCATCCGACCTCTAAG 196 CeSNP0037 AGTCCAGCGTTTATTATGCTCAGC ACTTCAATATGCGGTGAGGATTGT 474 DB15/T 3450 2024 5 表A.1 用 于油 莎豆SNP 检 测的73 组推 荐引 物序 列（续）引物名称 正向引物(5-3)反向引物(5-3)扩增长度(bp)CeSNP0038 AGATCATGGCAGAGTGGCTTTTAG CAGTATTCCGGTTTTTGCATTCTC 303 CeSNP0741 AACCGGACTAAAATAAGGGCAGTC GAGAGCCAGAACCTTGATGTTGTT 388 CeSNP0065 TCAGAACAAACAAAACCCTCCCTA GGGAAGGAAAGAGTGAACAGTGAA 312 CeSNP0066 TCAGAACAAACAAAACCCTCCCTA GGGAAGGAAAGAGTGAACAGTGAA 312 CeSNP0064 TCAGAACAAACAAAACCCTCCCTA GGGAAGGAAAGAGTGAACAGTGAA 312 CeSNP0609 GCACTTGCATATGAATGAGTCTGC CTCCATATTGTGCCAATGTATCCA 413 CeSNP0023 GCATCCCACTTAGGTGTTTGGATA TTTGTTCTTTACTCAGGCCTCAGG 331 CeSNP0088 CTGTCATCGAGGAATTCATATCCC ATGAACACTACGCATTGTGCAGTT 147 CeSNP0083 ATTAGGGAGGAAGCCTGTCAAAAG GATTGTCGATGAGGGCTTTTAGTG 343 CeSNP0407 CGGGAAAACCTCTCTTCGTAATCT GACGTGATTAATGGAACAGTGCTG 253 CeSNP1017 CAGACCAGACAGACAGGCCTAATT AGAGTCGGTGGTCTCTCTCTCAAA 499 CeSNP0965 CGGAGTACGAGACTTGACAGATGA GTCATCGATGCTTAGATCTGCAGA 337 CeSNP1016 GCCCTCTATTATGAGAAACATCGC GTGTATTGCTGCCAACAAAGATTG 443 CeSNP1015 CATCTGTACCCATTTTCTCCCTTG GGAAATTGGTGCTTAGAGCTAGCA 422 CeSNP1119 TATGGAAGAGGAGATGCATTGACA TGTAAGCTTTTGACAAACCAGCAG 468 CeSNP0793 AGATATCCCTGACTCGTTCACAGC GCACCAGAAAGAGAAGACGAAGAG 393 CeSNP0213 GCTGCTTTAACCCATCAGAAGCTA CATTGTGCGAACTTATGCTCAATC 108 CeSNP0092 TTTCAGCTACCGTGAACGATACAT ATGCATGCAGAAGATGATGAGATC 497 CeSNP0399 TGCCAGAAACCAGAATACAGATCA CCTCACAAAAGAATGCACAGTGTC 361 CeSNP0192 GGCAGATTCTGAGAAAAAGGATGA GGGCTCAGACGATTTCACTATGTT 354 CeSNP0282 CTCCGACGACGACACTACTGACTA CGTCACTTGTAAAACATGTTGGGA 453 CeSNP1255 TGTATTGGAACTATGCCTCGTTGA TGTACGCAATGCAGGTAATTGTCT 460 CeSNP0180 GGCGTCGTGAGTTGAAAAATCTAC GGGAGACTCAATATGATCAGGCAT 217 CeSNP0288 GCAACATGGAAAACCATCTTTAGC GGGTAGAGAGGCCTGAGACATACA 494 CeSNP1075 AGGAAATGCAGCTTTGCTATGTTC TTTTGAGTTGAGGCAGAGTCCTTC 472 CeSNP0352 GATGGATCAAGGAACAGAAGGAGA CCTATGTAGCCTTGCTTTCAGCAT 483 CeSNP0575 ATCATATTGTGATGGCAGCTGCTA AGGAGGAAACGTGATGACATTGTT 428 CeSNP0694 CCAGCATGTATTCAAACAGACGTC AACACCTCCAAGAGATCCACTCAC 144 CeSNP1219 TCAGTCGATAAAACAAGAGCCACA GGATGTGTCGGAGGAAAATATGAG 417 CeSNP0357 TCCACACTTCACTCGTGTAAACGT ATGGGGAATGTATCTGCACAAAAC 492 DB15/T 3450 2024 6 表A.1 用 于油 莎豆SNP 检 测的73 组推 荐引 物序 列（续）引物名称 正向引物(5-3)反向引物(5-3)扩增长度(bp)CeSNP0909 AATCCAAATCTACTGCAGCGAAAG AACTGTGATTCGATCTGTCACCAA 371 CeSNP1181 TTTCACTTGCACCCCTAGGAATAA CTAAAAGCCTAAAAGGAGCATGCA 455 CeSNP0312 TCTGTTGGTCCAATATAACCACGA GCCATGTAACGCTTTGTGTCTATG 451 CeSNP0910 AATCCAAATCTACTGCAGCGAAAG AACTGTGATTCGATCTGTCACCAA 371 CeSNP0358 TCCACACTTCACTCGTGTAAACGT ATGGGGAATGTATCTGCACAAAAC 492 CeSNP0936 CTTTGTAGGAAACGCCCATTGTAG GACGACGACTTGTTCTCAGTTCAA 348 CeSNP0321 TCGTTAGAACATACAGGGGCTTTT TATTCCAACAATACCGCCGATTAC 152 CeSNP1050 AATAACCCATCCGAACCTAGCATT TAAGAAAGAGGGAGGGAGAAGGTG 422 CeSNP0752 GGGAGAGGATTGCTTGGAGATATT GGATCTCTAACCGTCAGTTCTCCA 413 CeSNP1201 ATTAGGGTTGTTGCTTGCTGGTAA ATACCACCATTGGAACCATACCAG 346 CeSNP0454 ATCCTGAGGAATGGTTCTGACAAC TGGAGGCTGATAAAAAGGGTGTAA 416 CeSNP0508 ACTGAAGTGCCTCCAAACACTACC AGCCAAATAGTGCTCGATCTGATC 342 CeSNP1012 CCTTTCTTGCACAACCCATTTATC CTCGACTGCCTTTGTTCAGAAAAT 348 CeSNP0991 CTCCATCCACGTCTACGAGAAACT TACCCAATCAAATGGTTGGATAGG 322 CeSNP0453 GGAGTTGAGGTTCTCGAAAACAGA TGGAAGTGGTGAGCTATACGAACA 355 CeSNP0781 AAGGTTGAGAGACGTTTGAACCAG AGTGGAGAGCGCCTTTTTATAACC 492 CeSNP1182 TTTCACTTGCACCCCTAGGAATAA CTAAAAGCCTAAAAGGAGCATGCA 455 CeSNP0992 CTCCATCCACGTCTACGAGAAACT TACCCAATCAAATGGTTGGATAGG 322 DB15/T 3450 2024 7 B B 附录B（规范 性）油莎 豆73 个SNP 分 子标 记 的信息 油莎豆73个SNP 分子 标记 的 信息见 表B.1。表B.1 油莎 豆 73 个SNP 分 子标 记的信 息 SNP 编号 Chr 物理位置 参考位点 变异位点 序列（5-3）CeSNP0859 28 25478 T C AATGTTATTTTCTGATATGTTCTCGGGCTAGTGAAACTTATGCAACGGTGGACCTCATAACTACATGATATATTT/CAGATAAGGGTTAAGCTAATTGAACCCCAAACTTTGTACCCCGGACTTGTACCCCGCAAAATTTCCATATTAGCAA CeSNP1072 38 3400483 A T TCTCCAAAAAAGAAATTGTGCAAAGATCAATAATTTTATTTGAAATTAAGCATGATGATTCGCTAAAAAAAAAAA/TACAAATAATTTTTTTTTTTTGATTCATTGTGCATATATAATTATATATACTTCCAGAAAATAACACCACACACTC CeSNP0414 11 2973130 G A GTATCTAAACAGCTCGGAGGCTACACAGAAAAGCCGGCTAAATCTGTTTCCAGGCTACATGGAGAGATACAACAG/AATCTTTAGCCAAGGTACTTACTTTCTTTTGTATAAACAACACTCGGATCATTGAAGTGAATCTACATAAATATAC CeSNP0939 32 435088 T C TATGTGCTGCAGTAAACTGAAATCTGGGACCCAGTCAAATACTCAATACAGAATAGACACTGAGAATGTAACAAT/CTAGATCTGATTGTGTAAAATTGATCTGAGTTTGTAACCTATAGATGCTATGGACAGATATTCTATGGACGCTATT CeSNP1035 36 1932826 A G CATCTGATCGTACGATATACTTGAAATTTAGAGAACGTGGTAACTCTGGGAGACTGTATAGCACATCAGCTTCCA/GTAATATTTAGTTCTCTAAGACCAAGGAGACTTGCCATTGTAGCCGGTAATGACTTTAGAGATTTTGCATTTTGTA CeSNP1187 45 951378 T C CAATTGAAGCCATCGCTGGTCGAGGCATTTACTATGCTATTCGCTGACCGGGGTGTAGAAGGCTCTGCAAAGTGT/CGCCACTGGAGATGGAGATAACTCGGAAGATCGTTTTGGTGAATTGAGGTTCATTTGTGCCTGAGCAGTTACAGTT CeSNP0830 26 3020742 G T CATCCCTCCATATCCTCTGCAGCGCTGCACTGTGTAGGGCGAAATTTGAACCGTTAGATCATCTTGAGATCTGTG/TCTTGCTCAATCTTGAGATGATCTAACGGTTCACATTCCGCGCTACACAGTGCAGCGCTACAGAGGATGAGCACTC CeSNP0093 2 6323978 T G AAATTTTAAGCTTCATCAGAAATTATTGTACCCCCTGGTCATGAGTCTAGCTAGCTCTGTTCCTGCAAACATGTT/GAGCCAAAAAATGTTAACCCATGATCAATATTCAATACATGCAGATCTAATTTTAGTTTTGCCGGTAAACGTAGAT CeSNP0098 2 7182442 C T GTGAAGGAACTGCAGGATGAGAAGAATTAAGCAGCCAGATGGTATAAACGTACTGCTAGCCAGACTTGAAACAGC/TGCTCACCCCATATGCAAATTAAACACCATTTCAGTCTATTTGATATTGATTTTTCTGGACTTCTCATTCAAATAT CeSNP0243 5 6754210 G T TCCACCTTATCTGCATTTGTCAGGTCATTGAATTTTTCCTCGAATGCTGAGAGAGAGGGAAACGACTCGGGCTGG/TAAGAATTTTAGCAGGCTGAACATCTCGCCAAGGTTGTTCTGCAGGGGTGTCCCCGTCAATAAAACCCGCTGCCGA CeSNP0432 12 944840 G GGA GCAGGGGATTAGGAAACTCGACGAATGGGTATTCGATTGGACTATTGGTATTGGAATTGAATGAGCAACACATTG/GGAGAAAGAAGAATATTCATACACTGCAAATCTGCAATAGAGTTCACACTTGATAGTTGATACAGATGTAAAACAA DB15/T 3450 2024 8 表B.1 油 莎豆73 个SNP 分 子标记 的信 息（续）SNP 编号 Chr 物理位置 参考位点 变异位点 序列（5-3）CeSNP1018 36 159713 T C CCCGCGGCTAGTTTGCAGCGCCAAGGTGCCCGTCCTTCACCATACACAACATCATTGCAAGCAAGCTCCTTGCAT/CGACGTCCACCTCTAGGATCCCAGCAACGCACATCTAAGTTGCTCCGCAAAGCAGTCCCTGCCACCTCGTGCGTCC CeSNP0395 10 4353354 C A AGTGATGCCAGTATAGGAACAGTATGTTCCATGAATACAAGTGATTCGTTTTGTTATAGTTATCTGCATTGTAAC/AGAAGGCGTTCTTAATTAGTAATTCTCGTATTGTTTCAAAGAATATAATTACAAAAATTAAGATTTGTGAAACTTA CeSNP0397 11 381893 A G TGCGAGATGTACTCTTGCGTGCACTCCTCTGACATGCCACAGCAGGTGCACTTCACCTCCTCCACTTCTGATATA/GGAGCTGAGTTTTGTCGACTCCTTCGCCTCCTTCTTGAGCTCAAAAGAGAGGTCGGAAAGAGCCCGATGAAGTCCT CeSNP0541 15 4828146 C T GAGAAGAGTTTAACGGTAGATTTACGCACCGCTGTTCAATGGTCAAGGTGCCTGAGGGTGATTGAGCGGAGAGGC/TGGTGAGCTCACCGAGGCTCTTCAGAGAACCTTCCCGCCCGACTGGAATTCTCAAGAAGCGCAGGGCACTATTGGT CeSNP0014 1 1218615 T C TTCAGGCAGCTGACACAGTCCCAAATCGACTACATGAATGACATCAGGAGCAATTATATGATCTACAACTACTGT/CTATGACACCAAGAGATTCAACGGCGCCATGCCGCCAGAGTGCTACCTCCCTGCTTACTGATAAAGGCATGGTGCC CeSNP0081 2 4119603 C T TTATACCCTTTACAGCTTGTTCCTAATTAAATGAACTTTACCGATTCGATATTATTTTTCTATTCGTCTCTTAGC/TTGTCCCCAATTACAACCTTCCCTCTCCCCAATTAAATTTCTTTTATCTATATTATTTAAATGGAATAATTATTAT CeSNP0739 22 4626375 T C AACAGCAACTATGCATGTGTGTTCTGTTCTCTTAATTAATTAATTAATGCTAATATATATATAATATAATCTACT/CCTAGCTAGCAAGCTGATGGAGCTGTTCAACCTTTTACTTGAACATAACAGCTAGGCCTAGGCCTAGGCATGGCGA CeSNP0742 23 371656 C A GAATTTTTTTCTTCTCATTTTGTTTTGGGAACATTTTCTTTTCCACCCTTTGCTTGCTTAAAATTAAATGCACTC/AAAGTTCTCCTCTGAAACTTTCTAAAGCTGACGACTTTAATTTCTTGACCAGATATAATTCAAACATAATAGCAGT CeSNP0748 23 887468 C T AGTAACTTAATTAATCTTCAACATTTCAAGAAAACCGGGGAAAGCAAAATTTCACCTGTGAATGATCCAATTGCC/TATGCAAGTAACTAACACCTTCGAGCAACTGCAGCATTAGCCGCTTAACTTCGCTCGAGCTGAAGGGCTTAATCAT CeSNP0130 3 4024789 G A TTGGATTTCTGCAGGTAAACTGTTACAATCATCACCATCCGAGTCAGCTTTCGACAAAACCCATTTGCCTGGCCG/AGCAATGGACCGATATTAATGAATTTGCATCTGATTTGCTGAAAACCTTGACTTATGTTGAAAAGATGCTTACAGA CeSNP0409 11 2510780 G A AAGCGCTCCTACATGTTTTCCCTTTGACATTCGATTTCGGTCCCACCTTGCAAACGAACAAAGTCCACAACGCAG/ATCGCACCGTTGTACGAACCTCTGACCTCAATGGCCAGCCACGAGCAGCAGCTCGCTCTCCTCCTCGACTCCGCCG CeSNP0803 25 3044887 A G CTTGTGGCTATATATTTAATTAGGAGCTCCCCGGGAGCTTTGGCTGTCTGGACCTTGGAAAGAAAACCGCAGGCA/GTTTGAAATATCAACTTCTCTTCTTTTTCACTTGTAGCATGGTGTTTAACTCCTGCTGAAGGCACAATGCTAGGCT CeSNP1022 36 244132 C G AAAACACGCGGCAATTTCAAAATCGAGTTTGCTCGGCTAACCCCATCCAGAGCACTGTATTCTTCTTCTTTCAGC/GCCATCATTCCTTGCTTCCTTAACTGCAGTTGCATTACGTAGACTTGTTGTCAAAGATTTTCCACGACATATTGAC DB15/T 3450 2024 9 表B.1 油 莎豆73 个SNP 分 子标记 的信 息（续）SNP 编号 Chr 物理位置 参考位点 变异位点 序列（5-3）CeSNP0037 1 5183507 T C AGGATTCGAAAGCTCAGATCATGTCAAACTAATTCCAGTCCAGCGTTTATTATGCTCAGCACGCAACGTGTGTGT/CGCGCGCTATTCTGCAGGAGGAAAATTCCAGTTACAATAGAACTTAAAGAAGTATTTAGTATTTACCATTGATGTT CeSNP0038 1 5259978 G A TAATAGTACAAGGAATGATTTTTTTTTTTTTAAATTCTTTTAGCCACTTTACTGAATATTCATACATGAACAACG/AACAGGTCGGTAACAGAAGCTTGTTATCTGACAACGGGGTCGCAATCCCGCAAGAAGCTGAGAACTTCCTTGTAAA CeSNP0741 23 361107 C G TCACCGATGGCGCTGGTGGTCATGTGCGGCCAGCCCTGCAGCGGCAAGTCCACGGCCGCGGGGCGTCTCGCCGAC/GGCTCTGCGGACGGCGTTCGCTGCGGAAGGGAACCAAACCCTCGCCGTGACTGTGAGAGTCGTCGACGAGTCTTCC CeSNP0065 2 2960080 A C ATATCCATCCCCGGCTGTACTGCATTCTGCAGCTCATGACATGATCCGTTGGACCGTCTCGAGAATCGTGATGAA/CTCGGATCTTGAGACAATCCAACGGCCCACGTGATTAACTGCATATGCAGTACTGCGGAGTCCCTTCCTATTCATT CeSNP0066 2 2960147 C T GTGATGAATCGGATCTTGAGACAATCCAACGGCCCACGTGATTAACTGCATATGCAGTACTGCGGAGTCCCTTCC/TTATTCATTACATTACTTTACCAATGAGTGTAACAGTGTAACACACTGGGTGACTATACCAATTTTTATTGCACTC CeSNP0064 2 2960070 A T CTTCGGATTCATATCCATCCCCGGCTGTACTGCATTCTGCAGCTCATGACATGATCCGTTGGACCGTCTCGAGAA/TTCGTGATGAATCGGATCTTGAGACAATCCAACGGCCCACGTGATTAACTGCATATGCAGTACTGCGGAGTCCCTT CeSNP0609 18 1802060 T A TCTTAATATGGACAAGCGAAGTTTTATCATCCTATTCCTGCAGACGGATCTATAGACATTAATTATCGTTGATAT/AATATTTCCGATTACCATTGTGGATACATTGGCACAATATGGAGCTAGTTTTTAATTGTCATACAGATTTTGATTA CeSNP0023 1 3352098 T G ATATTTTTCTCTAAAAACAAACGTTTTAGATAAAAAAATTGCTATTAAAAATTGATAGTATAGTCTGGCGAACAT/GTGAATACAAATTATTTCCTGTAACCTGCCGAACCGGCCCTAAAAGACCCTGAGGCCTGAGTAAAGAACAAATTTG CeSNP0088 2 5072832 A G AAGGGGAATTTGTATAATTGCATCAACACACCTGTCATCGAGGAATTCATATCCCCTGCTGTACTGCATTATGCA/GGTTCACAGAGTCAACCATTGGATTGTCTCGAGATTCGTTCTAGTTTGGATCTCCAGACGATCCGATGGCTGACGC CeSNP0083 2 4721324 A G ATTAATAAAAACTGAACATGTCAAAGAAACTCTTACACCAGCATAACAGCTGAGGCGCAAGTGAGTTTTGTGTAA/GCTCCACAGGCCACTAAAAGCCCTCATCGACAATCCGGTCCACGTGGCTTTACACGAAGGACTGAGGATTATGTAA CeSNP0407 11 2340239 A T TTTTTTGGATTGAAAATTCTGTTTACAGTTAGTTAATAGTTAGGTAGTTACAGTCTGTTTGTTTTTTTACATTTA/TAAATTTTAAAAATTGTACTGGACTGCAGTACAATTTGTTACACGGTAGGAATTGGAATTGGTATTAAAATTGGAA CeSNP1017 36 110963 G T ATTAATAATGTAACTGAATAAAAAGAATACACAATTAAATAAATTTGGCAACATCTCCCCGTTCCTATCATAATG/TACAGTGGGAAACTTATGATTTGTATGACTTGAAACTAAAGGAACATGAAAAAGATGTATAGATTTTGACCTCTCC CeSNP0965 33 1062696 A T ACTGTTGAGAGCTCAACTGAAATTCAAGAAATTAAGTAACAAAATTTATTTTTTAGGAAATTTGACAATGAGCTA/TCGGAGGAAAAATCCTAGAATACTTGAGAGAACATTGCTTCAAAGGCGTAGTAGAGATTTTGCAAATTGGCTTCGT DB15/T 3450 2024 10 表B.1 油 莎豆73 个SNP 分 子标记 的信 息（续）SNP 编号 Chr 物理位置 参考位点 变异位点 序列（5-3）CeSNP1016 36 59732 T G TTCTATATCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCCTCTGCATTATATTAATTCATCTCCCCCTTCCTTCCATTTCATCTT/GACATGACAGCCTTGCCGAGCCCGTCTCCGAGCTTCAAAAATCATATGACCAATTCCTTCACCGCCTCCACCTCTA CeSNP1015 36 13793 A T CGATCGCATCTCATCATCCATCGGAGGCCGATTTTACTGTTTCTCTTCTCCTCCGATCTCTTCCCTCCTATGCTA/TTGCG